Đầu tháng 6 năm 2021 xuất hiện đoạn tin nhắn giữa Hồ Văn Cường, con trai nuôi Phi Nhung với một người lạ kể rằng anh muốn tách khỏi Phi Nhung và hoạt động độc lập, tỏ thái độ không muốn sống chung với cô. Sự kiện này khơi mào cho tin đồn cô “chèn ép, giữ hết cát-sê Hồ Văn Cường”.Tuy nhiên sau đó Phi Nhung lên tiếng cho rằng toàn bộ số tiền trên là do quản lý của cô giữ.
Ngày 26 tháng 8 năm 2021, Phi Nhung nhập viện Bệnh viện Chợ Rẫy vì mắc COVID-19.Cô qua đời ngày 28 tháng 9 năm 2021 do biến chứng COVID-19, hoại tử một phần phổi, bão cytokine và suy đa tạng. Ngày 8 tháng 10 năm 2021, thi hài của cô được hỏa táng.Tối cùng ngày, tro cốt của nữ ca sĩ được Việt Hương và gia đình đưa ra sân bay để gửi về Mỹ.
Vào tối ngày 4-11, ông Đoàn Ngọc Hải, một cựu quan chức CS nay đã bỏ hàng ngũ cán bộ, chuyển sang làm nghề lái xe công ích đã chia sẻ đoạn tin nhắn. Qua đó cho biết trước khi mất, nữ ca sĩ đã đi test Covid-19 để bay sang Mỹ, ai dè kết quả dương tính.
Điều này đã lật lại một sự thật rằng, nữ ca sĩ bị nhiễm Covid-19 lúc nào không hay, chỉ khi đi test để sang Mỹ mới biết mình bị nhiễm Covid-19. Tới nay chưa có điều tra đặc biệt nào để khẳng định chính xác nguồn lây nhiễm cho nữ ca sĩ Phi Nhung. Trên internet đã lan truyền nhiều thuyết âm mưu như Phi Nhung bị con là Hồ Văn Cường cùng bà Hằng bày mưu đầu độc, tìm kế cho Phi Nhung lây nhiễm Covid-19. Thuyết âm mưu này càng được khẳng định bởi logic là cả nhà Phi Nhung, kể cả Hồ Văn Cường cũng không bị nhiễm, mặc dù sống chung cùng nhà, điều khó tin, cũng khó xảy ra bởi virus Corona, nhất là biến thể Delta có khả năng lây nhiễm rất cao. Một người bị thì cả nhà cũng bị nhiễm.
